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所有内容: 常用分析/画图X

分享一个好用的遗传变异在线分析工具

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研究遗传的童鞋们,你们是否需到过如下问题:测序结果都是核酸变异信息,需要判断是否在编码区内,还得对照密码子表换算成氨基酸变异这个基因的遗传方式是AR还是XR需要查文献变异是否与疾病相关 ...

  • 发表于:2016-10-17
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  • HIS2016: 5th International Conference on Health Information Science

    27

    HIS2016: 5th International Conference on Health Information Science The conference website is at: http://www.his-conferences.org/2016/index.html. ------------------------------ ...

  • 发表于:2016-5-19
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  • 生物信息分析移动解决方案——SEQPAD

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    生物信息分析移动解决方案——SEQPAD生物信息的大数据时代,提取有效内容需超强的计算能力;生物信息分析软件众多,下载、安装、配置十分复杂;生物信息的传统服务器,无法移动需联网进行数据上 ...

  • 发表于:2016-4-29
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  • 热图争霸——没有最好,只有更好

    159

    热图争霸——没有最好,只有更好 之前给您介绍过,锐翌基因微生物组产品全面升级,然后我们介绍了众多新面孔,(点击以下题目可以回顾哦~) 微生物多样性16S测序分析 “三个分析 = 一篇文章” ...

  • 发表于:2016-4-21
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  • R丨ggplot2又是什么?

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    什么是ggplot2呢?ggplot2是一个用来绘制统计图形的R软件包。ggplot2是由其背后的一套图形语法所支持的,它可以绘制出很多美观的图形,同时能避免诸多繁琐的细节。ggplot2采用了图层的设计方式 ...

  • 发表于:2016-2-25
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  • 手把手教你用MEGA画进化树

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    对于进化树的构建,如果对理论的了解不深入,选择模型的时候用NJ或者ML建树较为妥当。对于初学者,小编首推MEGA软件,因为它是Nei开发的方法并设计的图形化软件,使用起来非常方便。MEGA(Molec ...

  • 发表于:2016-2-19
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  • 分享:Data Wrangling with Python_ O'Reilly (2016).pdf

    77

    Data Wrangling with Python_ Tips and Tools to Make Your Life Easier-O'Reilly (2016).pdf,欢迎下载!!! 链接: http://pan.baidu.com/s/1nu3vj8P 密码: yyau

  • 发表于:2016-2-12
  • 16条评论
  • 分享:ggplot2:数据分析与图形艺术.pdf

    111

    ggplot2:数据分析与图形艺术.pdf,欢迎下载!!! 链接: http://pan.baidu.com/s/1gdYtx0v 密码: mg1i

  • 发表于:2016-1-27
  • 33条评论
  • 认识我们的好伙伴“ROC曲线”

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    本帖最后由 美吉生物 于 2016-1-20 13:11 编辑 首先,介绍一下我们的小伙伴。 他的英文名字是receiver operator characteristic curve,小名叫接收者操作特性曲线;它是根据一系列不同的二分 ...

  • 发表于:2016-1-20
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  • 降维算法是个啥?

    61

    一说起算法,是不是立刻就这样啦?头好晕@@~这可如何是好?文章里面没有“使用XXX算法解决了OOO问题”之类的语言,怎么体现其高大上?然而,算法这个东东也不是可以随便用的,只有公理才是普遍 ...

  • 发表于:2016-1-4
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  • PCA、PCoA、NMDS、CCA、RDA傻傻分不清楚

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    PCA、PCoA、NMDS、CCA、RDA傻傻分不清楚 相信大家在做微生物多样性研究时经常听到PCA分析、PCoA分析,NMDS分析,CCA分析,RDA分析。它们对物种(或基因、功能)的分析具有重要作用,因而频频出 ...

  • 发表于:2015-12-11
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  • 小变异,大作用——无所不在的SNP

    149

    本帖最后由 realbio 于 2015-12-9 16:27 编辑 小变异,大作用——无所不在的SNP 技术介绍 SNP 即Single Nucleotide Polymorphism,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列 ...

  • 发表于:2015-12-9
  • 0条评论
  • 大样本RNA-seq数据的救星——共表达网络分析

    214

    本帖最后由 realbio 于 2015-11-20 17:28 编辑 大样本RNA-seq数据的救星——共表达网络分析 什么是共表达网络分析?基因共表达网络分析(Gene Co-expression Network Analysis)是根据基因表 ...

  • 发表于:2015-11-20
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  • Genespring GO 富集分析结果怎么导出

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    11:55:26 风语者 2015/11/20 11:55:26 请教,Genespring里面做了GO注释和富集分析,出现一大推这样的GO富集结果,怎么批量下载下来啊,不可能一个个地export list吧? ...

  • 发表于:2015-11-20
  • 1条评论
  • 用circos无法画links的问题

    45

    求大神指点:以下是我的circos 配置内容,为什么不能画link,却也不报错? 注:我几乎完全按照网上的教程中复制相关配置内容而来。所有输入文件的路径都是正确的。 ========================== ...

  • 发表于:2015-9-18
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  • DAVID使用说明文档

    42

    见附件

  • 发表于:2015-8-10
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  • PPI

    20

    PPI是什么: • Teardata中的用在物理数据库设计中的索引机制. • 数据行在AMP级聚合成分区. • 分区只是在AMP上将数据行排序. PPI可以提供的优势: • 增加可用性以提高某些特定查询的效率(特定 ...

  • 发表于:2015-8-10
  • 1条评论
  • 基因组可视化程序「Circos」vol.1—简介+安装

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    http://linxiao.name/archives/130 http://linxiao.name/wp-content/uploads/2012/09/%E5%B1%8F%E5%B9%95%E5%BF%AB%E7%85%A7-2012-09-17-%E4%B8%8B%E5%8D%8809.19.49.png很 好奇几 乎所有基因组 ...

  • 发表于:2015-8-10
  • 0条评论
  • [转载]circos教程

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    引子http://circos.ca/img/circos-sample-panel.png闲来无事,翻看CELL杂志,发现很多基因组的图都使用circos来作图,于是就去circos.ca网上看了一眼,发现果然是个基因组研究绘图强大工具,应 ...

  • 发表于:2015-8-10
  • 0条评论
  • 在Ubuntu中安装Circos

    19

    Circos是一个功能强大的数据和信息可视化工具,这好像是我迄今为止见到的最难安装的软件,折腾了半天才安装成功。在Ubuntu中安装,首先要按照其网站上的说明进行如下操作: tar xvfz circos-x.x ...

  • 发表于:2015-8-10
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