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请教reads比对到基因组的问题

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将reads比对到基因组的大概过程是怎么样的?是用参考基因组的cDNA序列来比对的吗?

  • 发表于:2015-3-23
  • 0条评论
  • 【教程】health小讲4:reads数对应fastq.gz文件大小

    163

    结论: 文件字符数和文件大小之间的转换 read 数目字符数文件大小(bit)未压缩文件大小(GByte)压缩文件大小(GByte) PE100_R1.fastq10^810^8 * 23510^8 * 235 * 8约21.7 GB约6GB PE100_R2 ...

  • 发表于:2015-1-14
  • 0条评论
  • soft-clipped reads是什么意思?

    45

    课程中说的soft-clipped reads还是不太清楚到底是什么意思?

  • 发表于:2014-12-24
  • 2条评论
  • bowtie2 paired-end和single-end mapping 疑问

    1621

    有个奇怪的事情想请教下~ 我用bowtie2 map paired end数据,mapping 完了之后,把unmap的reads挑出来,当做single-end的数据重新用bowtie2 map,可以再mapping上5w多条。这些mapping上的reads ...

  • 发表于:2014-7-16
  • 7条评论
  • reads的含义及用途?

    950

    测序的时候经常提到reads,请教大家,reads标准的定义是什么,它的用途是什么?谢谢

  • 发表于:2014-2-7
  • 1条评论
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