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数据分析相关软件

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本帖最后由 EE爱蓝色 于 2015-8-12 20:41 编辑 基因组 De novo 测序 基因组 De novo 测序使用的组装软件按原理分,主要有两类,一类是基于overlap graph的组装软件,有CABOG、 ARACHNE、 ReP ...

  • 发表于:2015-8-12
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  • 基因组测序相关术语解释

    187

    WG-BSA (全基因组重测序 BSA) 对已有参考基因组序列的物种的所有作图群体( F1、 F2、 RIL、 DH 和 BC1等),对亲本进行个体重测序,对某个极端性状材料混池测序,检测 SNP,获得与性状紧密关联 ...

  • 发表于:2015-8-12
  • 0条评论
  • 请教全基因组重测序后结果分析

    79

    对于测序零基础,但是老板让做一个家系全基因组重测序分析,结果筛选出来是SNP28个,接下来如何进一步筛选和 该疾病有关的基因呢?谢谢大家。 ...

  • 发表于:2015-3-5
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  • 【从零学测序】之癌症基因组重测序分析最后一讲

    1005

    【从零学测序】之癌症基因组重测序分析最后一讲之circos图的绘制视频和PPT, 大家在网站下载或群文件下载,晚8点开始视频直播答疑如期进行 另外今晚每周三测序中国论坛“橙色星期 ...

  • 发表于:2015-1-7
  • 14条评论
  • 【从零学测序】癌症基因重测序分析,第五讲视频文件

    894

    《从零学测序》:癌症基因重测序分析第五讲:体细胞拷贝数变异(CNV)与基因组结构变异(SV)。这次视频的声音可能不太好,望大家见谅 ...

  • 发表于:2015-1-4
  • 5条评论
  • 【从零学测序】癌症基因组重测序分析第四讲

    1392

    【从零学测序】之癌症基因组重测序分析第四讲 :Somatic SNV与Indel鉴定与注释。今天恰逢圣诞节,从平安夜开始,每周三测序中国论坛“橙色星期三”针对每期的主题进行测序问答风暴,有问 ...

  • 发表于:2014-12-24
  • 11条评论
  • 【从零学测序】之癌症基因组重测序第三讲视频

    1560

    【从零学测序】之癌症基因组重测序第三讲:测序实验流程、测序原理及基本的名词解释。将于12月17日晚8点直播,每周三课堂的直播形式是:授课视频先提前公布,大家下载或者直接在线观看, ...

  • 发表于:2014-12-17
  • 22条评论
  • 《从零学测序》:癌症基因重测序分析,第二讲视频文件

    1312

    欢迎大家下载观看哦!看完之后有疑问的,可以发帖提问,欢迎大家探讨。

  • 发表于:2014-12-10
  • 15条评论
  • Yeast重测序

    413

    有一个Yeast的重测序的项目,不知道有什么好的测序方案吗?PE+MP还是MiSeq?

  • 发表于:2014-12-10
  • 3条评论
  • 《从零学测序》:癌症基因重测序分析,第一讲视频文件

    1900

    欢迎大家下载观看哦!看完之后有疑问的,可以发帖提问,欢迎大家探讨。

  • 发表于:2014-12-4
  • 45条评论
  • 基因组重测序关于CNV分析的问题咨询?

    443

    各位好,小弟刚刚接触基因组重测序CNV分析,还在探索中,看很多文献中提到bin size。请问这个bin指的是什么意思?bin 100bp等同于100bp的滑动窗口吗? ...

  • 发表于:2014-12-4
  • 1条评论
  • 动/植物重测序,都研究哪些内容?

    1069

    动/植物重测序,都研究哪些内容? 除了gwas pca 进化树 群体结构分析之类的.

  • 发表于:2013-12-2
  • 2条评论
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