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  • 二代测序建库技术答疑专帖

    11449

    此次Gnomegen首席科学家王焱博士受测序中国seq.cn邀请,特开此二代测序建库技术答疑专帖。对站友们提出的问题给予解答,希望能够在和大家交流的过程中,相互学习,并开发出更多的能解决实 ...

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  • 求助:RNA-seq 数据经tophat 比对后,怎么计算map 到exon、intron...

    1340

    求助:RNA-seq 数据经tophat 比对后,怎么计算map 到exon、intron 和 intergenic region 的reads 数?怎么样计算uniquely mapped 的reads 数?

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  • 第20120828期集结号--Genome Browser使用教程

    1713

    In situation for anybody who is one particular of these persons and you need to believe when prior to you goi 1 million,michael kors usa shop online, $ 1 Hollywood superstars like ...

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  • cufflinks运行失败--SAM error on line XX: CIGAR op has zero length

    344

    The foil namely apt cater it outer safety,micheal kors replica, so that but when within case anybody accident occurs, the foil want face the plenary jerk over it Mike Gros (Michael ...

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  • Nature Protocols:空间转录组测序新技术

    10

    在真核细胞中,转录组的空间组织已经成为调节RNA转录后命运的一种有力手段,但是一般研究采用的是原位杂交或者原位的荧光染色,这项技术操作困难且通量低。近期来自中科院生物化学与细胞生物学 ...

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  • 新型长片段文库试剂盒显著改善PacBio测序质量

    25

    密歇根州安阿伯市2017年2月15日电 /美通社/ -- Swift Biosciences 今天宣布面向市场推出其 Accel-NGS® XL文库制备试剂盒,这是用于在Pacific Biosciences®(简称PacBio®)平台上对整个基因组 ...

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  • 诺奖得主PNAS文章公布最新测序技术

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    我们身体细胞内的DNA每日都会由于各种原因而受损,因此可以说细胞间DNA修复系统是维持生命的基础,但是对于这个基础机制科学家们并没有完全弄明白。近期来自北卡罗来纳州大学教堂山分校的研究人 ...

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  • 全面解读第四代测序技术

    140

    http://img.yigoonet.com/2017/0123/20170123045339394.jpg 纳米孔测序技术(又称第四代测序技术)是最近几年兴起的新一代测序技术。目前测序长度可以达到150kb。这项技术开始于90年代,经历了 ...

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  • 《Nature Methods》新技术:CRISPR+ 单细胞测序 =?

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    哈佛大学,Broad 研究院的研究人员提出了一种解决方法:他们将 CRISPR 筛选与文库筛选结合起来,通过整合 CRISPR 基因组编辑与单细胞 RNA 测序,平行确定多个基因的基因调控影响,在单个实验中 ...

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  • SMiLE-seq:一种加速遗传学研究进展的新技术

    48

    EPFL 的科学家们开发了一种技术,通过使 DNA 结合蛋白的表征更快,更准确,更高效。结果发表在在 1 月 16 日的《自然 - 方法》杂志上。基因含有用于产生细胞内所有蛋白质的 DNA 代码。 为了开始 ...

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  • 新一年,基因技术将继续在这7个领域大放异彩

    61

    未来的几年时间,全世界很多待解决的医疗难题都指向了一个解决方案——基因技术。 药物基因组学、直接面向消费者的基因测序的巨大进展,都令基因数据开始大量积累。内存计算技术的发展,让医学 ...

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  • LncRNA:从“转录噪声”到科研高地的逆袭

    41

    2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时,第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物,并将其命名为长链非编码RNA,也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里, ...

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  • 液体活检有多重要?2017年要做什么?

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    http://pic.biodiscover.com/files/7/kc/201612291905274806.jpg 2016年6月FDA批准了首个EGFR液体活检技术,推进了肺癌精准医疗的进程,也进一步推进了液体活检的商业化。根BCC分析,2020年“液 ...

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  • Nature:肿瘤液体活检有哪三种类型?

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    http://www.bio360.net/attachments/2016/12/1482824539cd94c4d9aafd0ef7.png液体活检(Liquid Biopsy)与传统的组织活检相比有着迅速、便捷、损伤性小等众多优点。临床医生可以用它来监测肿瘤对 ...

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  • 2016外泌体经典回顾 | 外泌体

    45

    自2007年首次在外泌体中发现mRNA和miRNA,外泌体相关的研究一直备受关注。有数据显示,目前,有关外泌体的学术论文已超20000篇,主要研究方向有癌症研究、神经科学、干细胞研究、生殖医学等。其 ...

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  • 关于ccfDNA的提取,你想知道的都在这里

    115

    自2015年以来,液体活检就在医疗诊断领域掀起了一阵新风暴。这是一种非侵入性的方法,有望替代目前的侵入性方法,在早期实现疾病的诊断和监控。如今,液体活检已经应用在无创产前诊断(NIPT)、 ...

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  • 北京生科院提出编码基因重建的新方法

    48

    http://img.yigoonet.com/2016/1128/20161128030556756.jpg 基于转录组数据(左)和基因组数据(右)的de Bruijn图 2016年11月,国际学术期刊Genome Biology在线发表了中国科学院北京生命科学 ...

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  • 『锐帮读』益生菌和藤黄果提取物真的能减肥吗?

    36

    益生菌和藤黄果提取物真的能减肥吗肥胖是个全球性的健康问题,它能引起糖尿病、心血管疾病甚至癌症等更严重问题。众多研究发现肥胖与肠道菌群密切相关。本研究采用16S测序技术,来揭示益生菌及 ...

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  • 16S、宏基因组、宏转录组测序:哪种“魔杖”适合你

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    本帖最后由 realbio 于 2016-11-24 11:19 编辑 16S、宏基因组、宏转录组测序:哪种“魔杖”适合你《神奇动物在哪里》上映在即,相信大家早就在期待魔法狂潮的再度来袭了。魔杖、飞天扫帚、隐 ...

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  • RNAs之间的网络调控:ceRNA与其miRNA海绵作用

    54

    RNAs之间的网络调控:ceRNA与其miRNA海绵作用 转录组学的高通量测序可以同时对mRNA,lncRNA,miRNA和circRNA进行研究,关注基因的表达差异变化是其中一方面主要的研究内容,除此之外,学者们更 ...

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  • 遗传学大牛PNAS公布一项最新测序技术

    157

    未来个性化医学,医生可能仅仅通过分析一份唾液样品,就能快速收集到患者谋者疾病的患病风险,以及最适合他的治疗方式。然而目前的新一代技术依然是一个很费钱的事。 来自哈佛大学Wyss研究所 ...

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  • 手把手教你获得高质量ccfDNA

    110

    http://www.iivd.net/data/attachment/forum/201610/03/001251wj40srv0s0gs4haj.jpg.thumb.jpg近几年,液体活检中的一个重要研究方向——循环游离核酸(ccfDNA)进展迅猛。ccfDNA最早是应用于 ...

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  • 单细胞基因表达分析的最新进展

    62

    将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上,它们都一样。实际上,它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平,还是蛋白质或代谢物的水平,这些细胞相差甚远,而这些差异可能对细胞行为产生深 ...

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  • 扫盲贴:如何评估NGS文库的质量?

    142

    NGS文库制备的目标是在DNA或cDNA片段上连接厂家特异的接头,让它们能够在NGS平台上测序。这个概念似乎非常简单,不过实现这个目标可比你想象的要复杂得多,而只有严格的质量控制才能确保最佳的 ...

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  • 数字PCR系列(一) 微滴式数字PCR与液态活检

    49

    MIT Technology Review杂志发布的2015年度十大突破技术(Breakthrough Technologies 2015)榜单上,与肿瘤个性化医疗密切相关的“液体活检(Liquid Biopsy)”名列其中。液体活检在转化医学研究 ...

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  • BioTechniques:大数据的可视化工具

    91

    如今,面对海量的生物数据集,人们往往感到束手无策。然而,这些TB级的数据有望带来新的假说、新的药物靶点,以及对生物系统的更彻底了解。数据可视化在其中扮演着至关重要的作用。在这一期的《 ...

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  • 2016国家自然科学基金:高通量测序

    143

    不全 不全面呀

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  • 2016国家自然科学基金:产前诊断与医疗

    57

    来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学 ...

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  • 2016国家自然科学基金:纳米孔测序技术

    65

    来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学 ...

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  • 2016国家自然科学基金:单细胞技术

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    来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学 ...

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  • 循环肿瘤细胞CTC检测富集方法

    57

    http://www.iivd.net/data/attachment/forum/201609/03/005826a5zayhdh0h1yyh5n.jpg.thumb.jpg图 :CTC 原理图 随着实体肿瘤的生长,周围微环境发生了特定的变化时,有一部分肿瘤细胞会获得异 ...

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  • 一文全面了解循环肿瘤细胞CTC 的检测

    44

    http://www.iivd.net/data/attachment/forum/201609/03/011435oipvpv2lw0gpu0m0.jpg.thumb.jpg图 :CTC 分析方法一览 利用免疫亲和或物理特性法可富集到CTC,接下来还需要结合有效的下游分析 ...

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  • 肿瘤基因组学数据库终结者:cBioPortal

    42

    随着芯片和高通量测序技术的广泛应用,在肿瘤研究领域积累了越来越多的基因组学数据,特别是像The Cancer Genome Atlas(TCGA)、International Cancer Genome Consortium(ICGC)等大型肿瘤基 ...

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  • LncRNA功能研究神器----TANRIC数据库

    31

    长链非编码 RNA ( Long non-coding RNA, lncRNA ) 是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,其在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。作为遗传学 ...

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  • 2016国家自然科学基金 SNP分析项目知多少

    65

    来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学 ...

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  • 2016国家自然科学基金:lncRNA研究项目

    54

    来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学 ...

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  • 2016国家自然科学基金评审结果:生物信息学项目

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    本帖最后由 slytjiaofei 于 2016-8-26 22:12 编辑 来自国家自然科学基金委员会的消息,8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16934项、 ...

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  • IBM新技术将液体活检精准度提高50倍,颠覆癌症诊断

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    http://www.clinicalomics.com/file/getimage/719  最近,一群来自IBM、普林斯顿大学与西奈山伊坎医学院的科学家们合作开发了一种新型的芯片实验室技术。应用这种技术,临床医生可以第一时间 ...

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  • 九大测序平台对比

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    http://pic.biodiscover.com/files/a/do/201607261202232299.jpg 1.sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流型号:3730XL样品要求:PCR产物:浓度≥5 ...

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  • Nat Methods发布新的DNA测序技术

    94

    最近,英国诺丁汉大学的科学家们首次证明,我们有可能实时地、有选择性地测定DNA序列片段,从而大大减少了分析生物样品所需的时间。 在Nature子刊《Nature Methods》上发表的一篇论文,描述了 ...

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  • 轻松捕获循环肿瘤细胞CTC(三)

    46

    循环肿瘤细胞(CTC)让人又爱又恨。一方面,它的出现让癌症早期检测有望成为现实,也让痛苦的组织活检成为过去。另一方面,血液中的CTC极其稀少,检测起来相当困难。好在,新的检测技术总在不断 ...

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  • 轻松捕获循环肿瘤细胞CTC(二)

    56

    捕获循环肿瘤细胞(CTC),无异于大海捞针。一管血中大约有3亿个细胞,而循环肿瘤细胞也许只有5个。现代的癌症诊断技术无法发现它们。因此,人们在开发新的工具。这一回,我们来看点别的。 Epi ...

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  • 轻松捕获循环肿瘤细胞CTC(一)

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    不知大家是否听说过矿井中的金丝雀。过去,煤矿工人常常带着金丝雀下井。这种鸟对危险气体的敏感度超过人体。如果金丝雀死了,矿工便知道井下有危险气体,需要撤离。对癌症而言,循环肿瘤细胞正 ...

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  • Cell:单细胞分析重大突破-纳米注射器!

    35

    生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上最 ...

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